Akcja filmu rozgrywa się sto lat po wydarzeniach z "Niani". Obdarzona magicznymi umiejętnościami niania (Emma Thompson) opiekuje się dziećmi pochodzącymi ze wsi i miasta, które zostały ewakuowane podczas II wojny światowej.

Niania McPhee i Wielkie Bum to kolejny rozdział uroczej, magicznej i chwytającej za serce baśni, która oczarowała dzieci na całym świecie. Emma Thompson powraca jako tajemnicza niania, która w cudowny sposób pojawia się zawsze tam, gdzie potrzebna jest jej pomoc. Tym razem słynna McPhee przybywa na rodzinną farmę, gdzie trwa wielka awantura pomiędzy niesfornymi, miejscowymi łobuziakami a ich rozpuszczonym kuzynostwem z miasta. Korzystając ze swych czarów, latającego motocykla i rozkosznych, tańczących świnek, Nanny McPhee na pewno znajdzie sposób, by dać swoim swym małym podopiecznym lekcję dobrych manier.

Kiedy niania McPhee (Emma Thompson) pojawia się w drzwiach domu zapracowanej młodej matki, Isabel Green (Maggie Gyllenhaal), odkrywa, że dzieci pani Green toczą zaciekłą wojnę domową z dwoma rozpieszczonymi kuzynami z miasta. Posiłkując się dosłownie wszystkim - od latającego motocykla i ożywionej statuy, po wspinającego się po drzewach prosiaka i słonia, który pojawia się w najdziwniejszych miejscach - Niania McPhee używa swojej magii, aby dać dzieciom pięć cennych lekcji, z których najważniejsza uczy jak się dogadać.

Wielka Brytania, lata 40. XX wieku. Isabel Green (Maggie Gyllenhaal) dzieli czas między obowiązki na rodzinnym gospodarstwie, pracę w sklepie oraz wychowywanie trójki dzieci: Normana (Asa Butterfield), Megsie (Lil Woods) i Vincenta (Oscar Steer). Jej mąż jest na froncie. Tymczasem na farmę przybywa kuzynostwo z Londynu, wychowane w wyższych sferach rodzeństwo Celii i Cyrila. Kiedy pociechy Isabel zaczynają toczyć otwartą wojnę z zarozumiałymi przybyszami, u drzwi domu Greenów pojawia się dziwna kobieta, niania McPhee (Emma Thompson). Ekscentryczna guwernantka wkrótce zaprowadza własne porządki. Wykorzystując czary, wnosi do trudnego życia rodziny Isabel nieco magii.